For at opnå formel anerkendelse som religion i Italien må en organisation gennemgå to trin. Det første trin er en proces, hvorved den nationale repræsentation af trosretningen i landet opnår anerkendelse som en juridisk person fra indenrigsministeriet. Efter ansøgningen er blevet indleveret, gennemfører indenrigsministeriet en undersøgelse af ansøgerens kvalifikationer, og hvis ansøgningen godkendes, bliver den registreret som en anerkendt religiøs forening. Når den proces er afsluttet og man har fået religiøs anerkendelse fra indenrigsministeriet, så er det muligt at tage et yderligere trin og forhandle en traktat med staten, der kaldes en Intesa. Dette er en særaftale med staten og er den højeste form for religiøs anerkendelse. Scientology kirken har aldrig søgt om religiøs anerkendelse på denne måde. I stedet er dens religiøse organisationer i Italien registreret som religiøse nonprofit organisationer.
Scientology kirkens formål og aktiviteter er blevet anerkendt som værende af en religiøs natur af den øverste domstol i Italien. Den italienske kassationsdomstol (Italiens højeste retsmyndighed) udstedte en skelsættende dom i Bandera og andre mod Italien (n.16835/97) i oktober 1997, hvori den anerkendt Scientology som et religiøst trossystem (hvilket betyder, at den har et religiøst formål og udøver religiøse aktiviteter). Retten analyserede kriterierne for at definere en religion, understregede myndighedernes pligt til ikke at begrænse religionsfriheden og konkluderede, at Scientology er et religiøst trossystem.
I februar og august 1998 godkendte finansministeren Scientology kirkerne for skattefritagelse og klassificerede kirkerne som ”religiøse nonprofit foreninger”.
Scientology kirken er også blevet anerkendt som religion ifølge mange andre juridiske og forvaltningsmæssige beslutninger i Italien. Denne utvetydige anerkendelse som religion blev anerkendt af den italienske højesteret i en anden kendelse fra 2001. Denne kendelse var baseret på de talrige og nu fremherskende afgørelser, der fastslår, at Scientology er en religiøs trosretning.
”[…] eftersom Scientology kirken er blevet anerkendt som en trosretning i USA, burde den være blevet anerkendt i Italien og dermed også have lov til at udøve sin tro og hverve nye medlemmer [...]”